Kataláz gén 5' promoter régió -262C>T mutáció referens egyéneknél

Nyomtatóbarát változatNyomtatóbarát változat
Konferencia: 
2010/2011. tanév
Tagozat: 
Molekuláris biológia, Fejlődésbiológia, Genetika, Bioinformatika, Genomika
Előadó szerző adatai
Név (format for foreign students: Last Name, First Name): 
Fejes Zsolt

Előadás adatai

Előadás címe: 
Kataláz gén 5' promoter régió -262C>T mutáció referens egyéneknél
Összefoglaló: 

A nagy koncentrációjú hidrogén-peroxid, de legfőképpen a belőle képződő hidroxilgyök károsíthatja a különböző sejteket, vörösvértesteket és a DNS-t is. A szervezetben jelen lévő patológiás koncentrációjú hidrogén-peroxidot a kataláz enzim bontja vízzé és oxigénné. A humán kataláz enzimet a 11-es kromoszóma rövid karjának p13-as lókuszán található kataláz gén kódolja. A kataláz gén 5’ promoter régió -262 helyén bekövetkező C>T mutáció hatással lehet a fehérje expresszióra. Egyes irodalmi adatok szerint a -262C>T polimorfizmus csökkent kataláz aktivitást eredményez különböző megbetegedésekben.

A -262C>T mutációt vizsgáljuk olyan megbetegedésekben, mint b-thalassemia, diabetes mellitus különböző típusai és vitiligo. Célom volt, hogy a viszonyításhoz kontrolloknál meghatározzam a genotípus gyakoriságot és a kataláz aktivitást.

A vér kataláz aktivitás mérését teljes vérből végeztem spektrofotometriás eljárással, majd a vérből DNS-t izoláltam. A kataláz gén -262C>T polimorfizmus vizsgálatához szükséges génszakaszt MxPro qPCR készülékkel sokszoroztam fel. A 185 bp hosszúságú PCR termékeket SmaI restrikciós enzimmel emésztettem, amely a vad szekvenciájú génszakaszt hasította. Az így keletkezett különböző hosszúságú DNS fragmenteket poliakrilamid gélelektroforézissel választottam el és a DNS sávokat ezüstfestési technikával tettem láthatóvá. A módszer ellenőrzésére 3 esetben DNS szekvenálás is történt.

Munkám során 80 olyan egyéntől származó mintát vizsgáltam melyek kataláz aktivitása és hemoglobin koncentrációja referens tartományon belüli volt. A -262C>T polimorfizmus vizsgálati eredményeit genotípusok (vad CC, heterozigóta CT és mutáns TT) szerint 3 csoportra osztottam férfiak, nők és férfiak+nők.
A CC és CT genotípusok között szignifikáns csökkenés volt, a kataláz aktivitásban, a férfiak (p:0,0179), a nők (p: 0,0229) és a férfiak+nők (p: 0,00088) csoportjában.
Hardy-Weinberg szerinti egyensúly van (<5,991): férfiak 0,240, nők 1,380, férfiak+nők 0,290.

A kataláz gén -262C>T mutáció esetén csökkent a kataláz aktivitás a kontroll férfiak és nők esetében. A különböző megbetegedések vizsgálatához ez a kontroll csoport szolgál viszonyítási alapként.

1. témavezető adatai
Név: 
Kósa Zsuzsanna
Intézet / Tanszék/ Klinika: 
Orvosi Laboratóriumi és Képalkotó Diagnosztikai Tanszék, Klinikai Kémiai és Molekuláris Genetikai Laboratórium
2. témavezető adatai
Név: 
Nyesténé Nagy Teréz
Intézet / Tanszék/ Klinika: 
Orvosi Laboratóriumi és Képalkotó Diagnosztikai Tanszék, Klinikai Kémiai és Molekuláris Genetikai Laboratórium

Támogatók: Támogatók: Az NTP-TDK-14-0007 számú, A Debreceni Egyetem ÁOK TDK tevékenység népszerűsítése helyi konferencia keretében, az NTP-TDK-14-0006 számú, A Debreceni Egyetem Népegészségügyi Karán folyó Tudományos Diákköri kutatások támogatása, NTP-HHTDK-15-0011-es A Debreceni Egyetem ÁOK TDK tevékenység népszerűsítése 2016. évi helyi konferencia keretében, valamint a NTP-HHTDK-15-0057-es számú, A Debreceni Egyetem Népegészségügyi Karán folyó Tudományos Diákköri kutatások támogatása című pályázatokhoz kapcsolódóan az Emberi Erőforrás Támogatáskezelő, az Emberi Erőforrások Minisztériuma, az Oktatáskutató és Fejlesztő Intézet és a Nemzeti Tehetség Program