Plazmamembrán és extracelluláris mátrix fehérjék vizsgálata agytumor mintákban

A daganatos megbetegedések sok országban vezető haláloknak számítanak, és nagy valószínűséggel a világ minden régiójában a megbetegedések és a halálozások vezető okai lesznek az elkövetkező évtizedekben. Az agydaganatoknak két jellemző típusa ismert a primer agytumorok közvetlenül az agy egyes régióiban alakulnak ki, a secunder agytumorok viszont más szervben kialakult tumorok áttétei, metasztázisai az agyban. Az elsődleges agydaganatokra jellemző, hogy invazívak, ezért kezelésük nagyon nehéz, a teljes gyógyulás nagyon ritka. Ezzel szemben a másodlagos agydaganatok jól körülírtak maradnak, sebészileg az esetek többségében eltávolíthatók. A tumorok invazivitásbeli különbségének oka lehet a különböző agytumor típusok eltérő fehérje expressziós profilja.
A DE-OEC Idegsebészeti Klinika Neuro-onkológiai Laboratóriuma agytumor mintákon végzett microarray analízissel több olyan gént azonosított, melyek mRNS szintjében eltérések mutatkoztak. Munkánk során a róluk szintetizálódott fehérjék mennyiségét kívántuk meghatározni a sebészeti beavatkozás során eltávolított agyszöveti mintákból.
A fehérjék mennyiségi meghatározására egy célzott tömegspektrometriás módszerrel végeztük el. A Multiple Reaction Monitoring (MRM) mód a tripla kvadrupóllal rendelkező tömegspektrométerek egy speciális mérési módja, amely specifikus egy adott fehérjére, és a fehérje azonosítás mellett infomációt nyerhetünk a fehérjék mennyiségére vonatkozóan. A minták tömegspektrometriás azonosítása után 21 fehérjét sikerült azonosítani, melyek mennyiségi változásait határoztuk meg az egyes tumor típusokban.